在人们对洁净手术室工程不了解的时候，可能会觉得洁净手术室有那么神奇吗?现而今，各大小医院都在建设洁净手术室，洁净手术室似乎又成了“万能”的了。确实，随着人们对净化工程的了解，人们已充分认识到洁净手术室的积极作用，然而，“万能”论也是不可靠的。
洁净手术室既不应神化，也不应妖魔化。
手术室历来给人以神圣、庄严的感觉，整洁的房间、洁白的床单，无影灯下穿着白大褂的医生……有人把洁净手术室说的一塌糊涂，妖魔化，说是又贵效果又不如什么什么，这是不诚实的。同时，也要明白，洁净手术室不是一个特殊的东西，做手术前，任何手术室都要消毒除菌的，空气净化是营造洁净环境的方式之一。
即便实施了洁净手术室工程，严格的管理也是必要的。
即便实施了洁净手术室工程，建设了洁净手术室，在使用过程中，也还要做好设备的检查、维修工作，相关人员的培训工作以及建立严格的管理规范。有人把洁净手术部称为一种“高风险的医疗设备”，运行管理要求多。某些工作人员混淆了洁净手术室与普通手术室的概念，认为层流是万能，其实层流只是对空气起到过滤作用，对手术室的清洁度要求反而更高。
洁净手术室工程越来越少?
在国外出现了一定的趋势。国外随着医疗技术与设备的进步，使得手术医护人员减少，手术创面缩小，微创手术等发展，对室内换气次数、压差要求确实降低，空气净化对术后感染控制作用缩小。这种发展值得医疗机构重视。
洁净手术室工程须因地制宜
在建设洁净手术室的过程中，应做到因地制宜，结合医院的实际情况，制定合理的设计、施工方案，有序施工。洁净室的级别、面积、送风形式等都应结合医院情况来确定，盲目建设高级别的层流手术室是没有必要的。
正确的认识是实践的基础，深入的理解相关规范，这是实施手术室工程的基础。